Escherichia coli con el plásmido mcr-1 y blaCTX-M. Primer caso en USA.

El reciente descubrimiento de un gen de resistencia a la colistina, mcr-1, transportado por plásmido, anuncia la aparición de bacterias verdaderamente pan-resistentes a los medicamentos. El gen se ha encontrado principalmente en Escherichia coli, pero también ha sido identificado en otros miembros de la familia Enterobacteriaceae a partir de muestras de humanos, animales, alimentos y ambientales en todos los continentes.

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En respuesta a esta amenaza, a partir de mayo de 2016, todos los aislados clínicos de E. coli productores de β-lactamasas de espectro extendido (BLEE) remitidos al laboratorio de microbiología clínica del Walter Reed National Military Medical Center (WRNMMC), Maryland-USA, se probaron para determinar su resistencia a la colimicina por E-test.

Como consecuencia de lo anterior, diversos autores, en un trabajo publicado en la revista Antimicrobial Agents and Chemotherapy (primer firmante Patrick McGann), han presentado la presencia de mcr-1 en una cepa de E. coli aislada de un enfermo con una infección del tracto urinario (UTI) en los Estados Unidos.

El E. coli MRSN 388.634 se cultivó de la orina de una mujer de 49 años de edad que había acudido a una clínica en Pensilvania el 26 de abril 2016 con síntomas indicativos de una infección urinaria. El aislado fue remitido al WRNMMC, donde las pruebas de sensibilidad indicaron la presencia de un fenotipo BLEE:

Perfil de resistancia antibiótica de la cepa MRSN 388634 CMI (μg/ml) Perfil de resistancia antibiótica de la cepa MRSN 388634 CMI (μg/ml)
Colistina 4 Imipenem ≤ 0,25
Ampicillina >16 Meropenem ≤ 0,25
Amoxacillina/clavulanico 16/8 Gentamicina >8
Piperacillina-tazobactam 4/4 Tobramicina >8
Cefazolina >16 Amikacina ≤8
Cefepima >16 Ciprofloxacino >2
Ceftazidima >16 Levofloxacino >4
Ceftriaxona >32 Tetracyclina >8
Aztreonam >16 Nitrofurantoina ≤ 16
Ertapenem ≤ 0,25 SXT >2/38

SXT:Trimethoprim/sulfamethoxazol

La CMI para la colistina era de 4 μg/ml, confirmada por microdilución en caldo. El gen mcr-1 fue detectado por RT-PCR, y posterior secuenciación en PacBio RS II y secuenciador de sobremesa Miseq.

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E. coli MRSN 388634 pertenecía al clon ST457, identificado por primera vez en 2008 en el Reino Unido a partir de un cultivo de orina, y posteriormente en Italia en un aislado de un hemocultivo, donde se encontró que la bacteria albergaba los genes blaKPC-3 y blaCTX-M-55. La nueva cepa MRSN 388,634 lleva 15 genes de resistencia a los antibióticos, pero no carbapenemasas, albergados en dos plásmidos.

El primer plásmido, pMR0516mcr, es de 225.707 pb de tamaño y pertenece al grupo de incompatibilidad F18: A-: B1. El análisis de alineamiento de secuencias por el programa BLAST indicó que pMR0516mcr representaba un nuevo plásmido IncF, que comparte 89 Kb de secuencias homólogas con pHNSHP45-2, un plásmido IncHI2 50 descrito por Liu y cols. en UK en el 20018. Esta secuencia compartida contiene mcr-1 en asociación con ISApl1 , pero con ubicación y orientación diferente en el pMR0516mcr.

El pMR0516mcr también llevaba 7 genes adicionales de resistencia a antibiótica, incluyendo el gen de BLEE blaCTX-M-55. El segundo plásmido, pMR0416ctx, era de un tamaño de unos 47 Kb y fue asignado a IncN. Albergaba 7 genes de resistencia a antibiótica incluyendo blaCTX-M-14.

La cepa MRSN 388623 ha sido depositada en Genbank con el número de acceso SRP075674.

McGAnn P, et al. Escherichia coli Harboring mcr-1 and blaCTX-M on a Novel IncF Plasmid: First report of 2 mcr-1 in the USA. Antimicrob Agents Chemother 2016. doi:10.1128/AAC.01103-16