Procedimiento combinado MALDI-TOF MS y Vitek 2, para bacterias urinarias

background-blue-gradient-1    La identificación rápida y las pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos (PAS) de las bacterias causantes de infecciones permiten un tratamiento rápido y preciso. Por lo general, se necesitan de 18 a 48 horas para la identificación de patógenos microbianos que causan infecciones del tracto urinario (ITU) por medio de un cultivo de orina y, además, requieren de 18 a 24 h adicionales para los test de sensibilidad.

img-2 Wei Li (Department of Clinical Laboratory, Qilu Hospital of Shandong University, China) y otros nueve autores más, también de  hospitales de Shandong, han dado a conocer en la revista Frontiers in Microbiology un sistema de identificación rápida y sensibilidad antibiótica de las bacterias del tracto urinario usando un procedimiento basado en el sistema MALDI-TOF.

El objetivo del estudio fue acortar el tiempo de diagnóstico de las ITU combinando la detección de patógenos mediante citometría de flujo, la identificación microbiana por el sistema MALDI-TOF MS (desorción láser asistida por matriz mediante espectrometría de masas con tiempo de desorción e ionización), y la técnica PAS utilizando el sistema VITEK 2 para el análisis directo de muestras de orina. Se analizaron 1.638 muestras de enfermos con sospecha de ITU enviadas al laboratorio de microbiología para su cultivo. Cada muestra de orina tenía un volumen aproximado de 30 ml y se dividió en tres alícuotas. El procesamiento de la orina incluyó centrifugación diferencial y dos lavados para enriquecer la fracción bacteriana para uso directo con el MALDI-TOF MS.

De un total de 1,638 muestras de orina, 307 resultaron positivas con el analizador automático de partículas de orina UF-1000i. Entre ellos, 265 tuvieron un crecimiento significativo de un solo microorganismo. Se obtuvo la identificación directa en 229 (86,42%) de estas 265 muestras, y no se identificó erróneamente ningún patógeno.

Además, se obtuvo la identificación de especie en 163 (88,59%) de las 184 muestras con bacterias gramnegativas, y 27 (38,03%) de las 71 muestras con bacterias grampositivas. VITEK 2 AST se aplicó para 117 muestras con un solo microorganismo. Los datos de Enterobacteriaceae mostraron una tasa de concordancia de categorías de antimicrobianos del 95,1% (1301/1368), con tasas de error menor, mayor y muy mayor del 3,95% (54/1368), 0,88% (12/1368) y 0,07% (1/1368), respectivamente.

En el caso de Enterococcus spp., el acuerdo categórico global fue del 92,94% (158/170), con una tasa de error menor del 2,94% (5/170) y una tasa de error mayor del 4,12% (7/170).

img3 El tiempo de respuesta de este procedimiento combinado para diagnosticar las ITU fue de 1 h para la identificación de patógenos y de 6-24 h para el LAP; notablemente, sólo se necesitan de 6-8 h para el LAP de Enterobacteriaceae utilizando el sistema VITEK 2.

En general, nuestros hallazgos muestran que la combinación de citometría de flujo, MALDI-TOF EM y VITEK 2 proporcionó una identificación directa, rápida y confiable y un método de PAS para evaluar muestras de orina, especialmente para infecciones bacterianas por gramnegativos.

 

Wei Li, et al. Rapid identification and antimicrobial susceptibility testing for urinary tract pathogens by direct analysis of urine samples using a MALDI-TOF MS-based combined protocol. Front Microbiol 2019; | doi: 10.3389/fmicb.2019.01182